В настоящее время нет окончательного ответа на данный вопрос, однако Рабочая группа по иммунофлуоресцентной микроскопии сформировала ряд положений на основе согласованного мнения экспертов в этой области: 

1. Иммунофлуоресцентная микроскопия клеток респираторного эпителия может подтвердить патогенез мутации (например, миссенс-мутации в генах, кодирующих белки 35 радиальных спиц). 
2. Иммунофлуоресцентная микроскопия клеток респираторного эпителия может выявить ПЦД в некоторых случаях у пациентов с нормальной ультраструктурой ресничек или тонкими ультраструрными дефектами. 
3.  Иммунофлуоресцентная микроскопия клеток респираторного эпителия может помочь установить диагноз ПЦД при дефектах наружных и внутренних динеиновых ручек, дезорганизации микротрубочек (мутации генов CCDC39/CCDC40), гены, кодирующие белки радиальных спиц (мутации генов RSPH1, RSPH3, RSPH4A, RSPH9), центральной пары микротрубочек (мутации гена HYDIN) и дефектах, связанных с нексином.

Комментарии: Метод иммунофлюоресцентной микроскопии с мечеными антителами к различным белкам ресничек относительно дешевле и более прост в выполнении по сравнению с другими диагностическими методиками, однако, для того чтобы его можно было бы рекомендовать к использованию в широкой практике к настоящему времени недостаточно исследований по валидации данного метода в когортах пациентов с ПЦД и контрольных группах здоровых индивидуумов.

Метод иммунофлюоресценции для диагностики ПЦД находится на стадии разработки внедрения в ФГБНУ «МГНЦ» имени акад. Бочкова.